Análise global da regulação transcricional do gene de cerato-platanina epl1 em Trichoderma reesei
Trichoderma reesei é um dos fungos mais bem estudados e um dos principais produtores de celulases, enzimas que atuam na degradação de biomassa lignocelulósica. Apesar do amplo conhecimento sobre o sistema celulolítico desse fungo, pouco se sabe sobre a forma como ele reconhece o meio extracelular. N...
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| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2022 |
| País: | Brasil |
| Institución: | Universidade de São Paulo (USP) |
| Repositorio: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| Idioma: | portugués |
| OAI Identifier: | oai:teses.usp.br:tde-09052022-101527 |
| Acceso en línea: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17131/tde-09052022-101527/ |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | Cerato-platanin Cerato-platanina epl1 RNA-seq Trichoderma reesei |
| Sumario: | Trichoderma reesei é um dos fungos mais bem estudados e um dos principais produtores de celulases, enzimas que atuam na degradação de biomassa lignocelulósica. Apesar do amplo conhecimento sobre o sistema celulolítico desse fungo, pouco se sabe sobre a forma como ele reconhece o meio extracelular. Nesse contexto, a família de proteínas cerato-plataninas (CPs) tem ganhado destaque por sua capacidade de se ligar e afrouxar resíduos celulósicos. CPs são encontradas exclusivamente em fungos e apresentam similaridade estrutural com expansinas vegetais. Este trabalho tem como objetivo contribuir para o entendimento do papel de EPL1 de T. reesei. Para isso, foi feita a construção do mutante nocaute (Δepl1) e os experimentos foram realizados em comparação com o parental QM6a. A deleção de epl1 não alterou as atividades celulolíticas do fungo quando cultivado em celulose em estado submerso (FS), no entanto, quando cultivado em estado semi-sólido (FES) com bagaço de cana de açúcar, houve diminuição da atividade β-glicosidase. Para a análise do transcriptoma global de Δepl1, foi realizado o sequenciamento de nova geração das linhagens mutante e parental cultivadas em celulose 1% por 72 horas. Dos 9.143 genes anotados no genoma de T. reesei, 760 foram considerados diferencialmente expressos, sendo 260 exclusivos para QM6a, 214 genes exclusivos em Δepl1 e 286 compartilhado entre eles. A maioria dos genes que estavam up regulados no mutante pertenciam a categorias do Gene Ontology descritas como transporte de ácido orgânico, atividade oxidorredutase, transporte, ligação de polissacarídeo e ligação de carboidratos. As Enzimas ativas de Carboidratos (CAZymes) envolvidas no remodelamento da parede do fungo mostrou-se up reguladas na linhagem Δepl1. Os resultados mostram o papel de EPL1 no reconhecimento e fisiologia do fungo durante a produção de celulases. Espera-se com esses resultados contribuir para uma melhor compreensão do papel desempenhando por EPL1 em T. reesei. |
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