O problema do particionamento de similaridade máxima

Neste trabalho, nós propomos um novo problema de otimização combinatória envolvendo sequências de caracteres chamado Problema do Particionamento de Similaridade Máxima. Apresentamos também uma prova de que esse problema é NP-difícil no sentido forte, o que signi fica que não existe um algoritmo poli...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Zaccaron, Alex Zanella
Tipo de recurso: tesis de maestría
Estado:Versión publicada
Fecha de publicación:2015
País:Brasil
Institución:Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS)
Repositorio:Repositório Institucional da UFMS
Idioma:portugués
OAI Identifier:oai:repositorio.ufms.br:123456789/2590
Acceso en línea:https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/2590
Access Level:acceso abierto
Palabra clave:Computação
Computer Science
Complexidade Computacional
Computational Complexity
Otimização Combinatória
Combinatorial Optimization
Descripción
Sumario:Neste trabalho, nós propomos um novo problema de otimização combinatória envolvendo sequências de caracteres chamado Problema do Particionamento de Similaridade Máxima. Apresentamos também uma prova de que esse problema é NP-difícil no sentido forte, o que signi fica que não existe um algoritmo polinomial e nem pseudo-polinomial que o resolve, a menos que P = NP. Além disso, desenvolvemos e testamos duas heurísticas baseadas na estratégia gulosa que encontram soluções para o Problema do Particionamento de Similaridade Máxima em tempo polinomial. Este trabalho também traz uma aplicação do problema em questão através da modelagem de um problema importante da Biologia Computacional chamado problema da reconstrução e quanti ficação de transcriptoma, modelagem essa pioneira na abordagem desse problema omo um problema de otimização combinatória envolvendo sequências.