Molecular characterization of the 5S rDNA non-Transcribed spacer and reconstruction of phylogenetic relationships in Capsicum
Capsicum incluye ca. 41 especies de ajíes. En este trabajo original, el espaciador no-transcrito (NTS) del ADNr 5S fue PCR-amplificado, clonado, secuenciado y caracterizado en 23 taxones de nueve clados de Capsicum, divergentes en origen, fruto y cromosomas, y comparado a lo largo de Solanaceae. El...
| Autores: | , , , |
|---|---|
| Tipo de recurso: | artículo |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2021 |
| País: | Argentina |
| Institución: | Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
| Repositorio: | CONICET Digital (CONICET) |
| Idioma: | inglés |
| OAI Identifier: | oai:ri.conicet.gov.ar:11336/167947 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/11336/167947 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | CHILI PEPPERS GENETIC VARIABILITY MOLECULAR DOUBLE PURPOSE MARKER PHYLOGENY RIBOSOMAL NTS https://purl.org/becyt/ford/1.6 https://purl.org/becyt/ford/1 |
| Sumario: | Capsicum incluye ca. 41 especies de ajíes. En este trabajo original, el espaciador no-transcrito (NTS) del ADNr 5S fue PCR-amplificado, clonado, secuenciado y caracterizado en 23 taxones de nueve clados de Capsicum, divergentes en origen, fruto y cromosomas, y comparado a lo largo de Solanaceae. El NTS se organiza en tres regiones estructurales distintas de acuerdo a contenido GC, variabilidad y elementos reguladores; la variabilidad genética del NTS en Capsicum y géneros relacionados se agrupó en categorías taxonómicas definidas. Las secuencias NTS de Capsicum y taxa relacionados también se agruparon en categorías reconocidas -género, sección, clado, especie, variedad- durante la reconstrucción de un árbol filogenético de máxima-verosimilitud y diversas redes filogenéticas. De la combinación de datos genéticos y filogenéticos del NTS surge un escenario evolutivo que considera monofilia y diversificación de Capsicum a lo largo del tiempo. Nuestro análisis es original al incluir todas las especies domesticadas de Capsicum, mayoritarias en colecciones y programas, además de un amplio número de ajíes silvestres que demandaban mayor caracterización genética. El NTS constituye un marcador de doble propósito en Capsicum, al evaluar directamente variabilidad genética y reconstruir relaciones filogenéticas extensas, además de ser útil a la caracterización de germoplasma y estudios evolutivos en Solanaceae. |
|---|