IDENTIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE TRANSPORTADORES DE FÓSFORO (PHT1) Y ZINC (ZIP) EN TOMATE (Solanum lycopersicum L.)
Las plantas poseen un sistema de respuesta ante condiciones ambientales no favorables que se perciben como condición de estrés. Dos grandes familias de proteínas participan en la homeostasis celular del fósforo y zinc, las cuales se asocian con los mecanismos de regulación del transporte de estos el...
| Autor: | |
|---|---|
| Tipo de recurso: | tesis doctoral |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2019 |
| País: | México |
| Institución: | Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo |
| Repositorio: | Repositorio Institucional del CIAD |
| Idioma: | español |
| OAI Identifier: | oai:ciad.repositorioinstitucional.mx:1006/1169 |
| Acceso en línea: | http://ciad.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1006/1169 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | info:eu-repo/classification/cti/6 info:eu-repo/classification/cti/31 info:eu-repo/classification/cti/3103 info:eu-repo/classification/cti/241719 |
| Sumario: | Las plantas poseen un sistema de respuesta ante condiciones ambientales no favorables que se perciben como condición de estrés. Dos grandes familias de proteínas participan en la homeostasis celular del fósforo y zinc, las cuales se asocian con los mecanismos de regulación del transporte de estos elementos para cubrir las funciones biológicas de las células. En el presente trabajo se utilizaron bases de datos disponibles del genoma del tomate (Solanum lycopersicum L.) para la caracterización de secuencias putativas de transportadores de la familia ZIP; mientras que se dedujeron roles funcionales a partir de secuencias no caracterizadas de miembros de la familia PHT1. Se realizó una búsqueda bibliográfica exhaustiva de donde se seleccionaron las secuencias candidatas a ser caracterizadas y evaluadas en tomate; posteriormente se realizó una caracterización in silico de tres genes de la familia ZIP (ZIP4, ZIP5 y ZIP8) con el uso de diversas herramientas para evaluar su regulación ante deficiencia inducida de Zn en plántulas bajo sistema hidropónico. La estrategia aplicada y el estado del arte recopilado de la caracterización de ambas familias de proteínas, se presentan en dos artículos de revisión. A partir de esta revisión, se seleccionaron las condiciones de espacio-temporalidad a evaluar en plantas de tomate Micro-tom. A partir del análisis de secuencias se realizaron modelaciones y caracterizaciones in silico y se reportan los distintivos estructurales y conformacionales que las asemejan a secuencias previamente caracterizadas. Se caracterizaron dos isoformas de la familia PHT1 en tomate, las cuales no han sido reportadas previamente y éstas presentan sitios de acción potencialmente distintivos. Adicionalmente se identificaron cinco nuevos miembros de la familia ZIP (ZIP2, 3, 4, 5 y 8) en tomate cuyo análisis in silico muestra alta homología con las secuencias previamente reportadas. Los ensayos experimentales de expresión génica realizados bajo condiciones limitadas en aporte de Zn sugieren la regulación temporal de ZIP5 y ZIP8. De esta investigación derivó información que sustenta la existencia de secuencias candidatas a cumplir funciones de transporte de Zn y P, las cuales no han sido funcionalmente caracterizadas; sin embargo, es necesario ampliar los estudios para confirmar su identidad y función, que sirva de base para considerarlas en el diseño futuro de estrategias de manejo nutrimental de cultivos. Palabras clave: ZIP, tomate, zinc, homeostasis. |
|---|