Aplicación web para el estudio de relación entre Lupus y otras enfermedades autoinmunes basado en minería de textos de Pubmed
El aumento de las publicaciones en literatura biomédica dificulta a los especialistas estar al día en su campo de estudio o bien resumir la información contenida en miles de publicaciones. En el presente trabajo se aplica minería de textos a abstracts de Pubmed entregando al usuario una aplicación w...
| Autor: | |
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| Tipo de recurso: | tesis de maestría |
| Fecha de publicación: | 2020 |
| País: | España |
| Institución: | Universitat Oberta de Catalunya (UOC) |
| Repositorio: | O2, repositorio institucional de la UOC |
| OAI Identifier: | oai:openaccess.uoc.edu:10609/107826 |
| Acceso en línea: | http://hdl.handle.net/10609/107826 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palabra clave: | autoimmune data mining PubMed minería de datos autoinmune mineria de dades Data mining -- TFM Mineria de dades -- TFM Minería de datos -- TFM |
| Sumario: | El aumento de las publicaciones en literatura biomédica dificulta a los especialistas estar al día en su campo de estudio o bien resumir la información contenida en miles de publicaciones. En el presente trabajo se aplica minería de textos a abstracts de Pubmed entregando al usuario una aplicación web interactiva de forma de facilitar el uso y distribución de la herramienta. Se ha elegido la temática de enfermedades autoinmunes (y en especial el caso de Lupus eritematoso) ya que en conjunto estas afectan a más del 10% de la población mundial. La aplicación iMune permite explorar la información contenida en los abstracts de Pubmed (fuente con más de 30 millones de citas de bibliografía biomédica), buscar publicaciones sobre una enfermedad de interés y resumir su contenido en nubes de palabras y genes. Para el caso particular de Lupus, permite explorar genes potencialmente relacionados distinguiendo los que ya se encuentran mencionados en bibliografía de referencia. Las relaciones gen-enfermedad se estudian empleando análisis semántico latente. Además, se explora la relación de los síntomas más comúnmente presentados en pacientes de Lupus con otras enfermedades autoinmunes. La herramienta ha permitido resumir las palabras y los genes contenidos en publicaciones de enfermedades autoinmunes, así como sugerir genes relacionados que pueden ser comprobados en literatura o en caso contrario,sugerir un nuevo conocimiento. Así mismo, ejemplifica la complejidad del diagnóstico al verificar que un síntoma en particular es presentado por una variedad de enfermedades autoinmunes. |
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