Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantes
La incorporación de las técnicas de secuenciación genómica mediante secuenciación de nueva generación ha revolucionado la microbiología clínica, innovando y mejorando el diagnóstico clínico de las enfermedades infecciosas. Hoy en día, la secuenciación de genoma completo en enfermedades infecciosas t...
| Autores: | , , , , , , , , , , , |
|---|---|
| Formato: | artículo |
| Estado: | Versión publicada |
| Fecha de publicación: | 2022 |
| País: | España |
| Recursos: | Universidad de Sevilla (US) |
| Repositorio: | idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla |
| OAI Identifier: | oai:idus.us.es:11441/165907 |
| Acesso em linha: | https://hdl.handle.net/11441/165907 https://doi.org/10.15568/am.2021.814.rev03 |
| Access Level: | acceso abierto |
| Palavra-chave: | Secuenciación genómica SARS-CoV-2 Variantes Andalucía. |
| id |
ES_2052fd3de931b225d0feb5fbe94de900 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:idus.us.es:11441/165907 |
| network_acronym_str |
ES |
| network_name_str |
España |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantesSARS-CoV-2 Genome Sequencing in Andalusia, Methodology and Study of VariantsSalazar, Adolfo deFuentes López, AnaViñuela, LauraCamacho Martínez, PedroChueca, NataliaMerino Díaz, LauraPérez Florido, JavierCasimiro Soriguer, Carlos S.Dopazo Blázquez, JoaquínLorusso, NicolaGarcía, FedericoLepe Jiménez, José AntonioSecuenciación genómicaSARS-CoV-2VariantesAndalucía.La incorporación de las técnicas de secuenciación genómica mediante secuenciación de nueva generación ha revolucionado la microbiología clínica, innovando y mejorando el diagnóstico clínico de las enfermedades infecciosas. Hoy en día, la secuenciación de genoma completo en enfermedades infecciosas tiene multitud de aplicaciones en virología, bacteriología, resistencia antibiótica, epidemiología y salud pública. Con la aparición del SARS-CoV-2, se ha visto subrayada la importancia del análisis y estudio de las secuencias genéticas. Desde la identificación inicial del SARS-CoV-2, hasta la fecha, se han compartido, a nivel mundial, más de 414.575 secuencias genómicas completas a través de bases de datos de acceso público. La capacidad de monitorizar la evolución viral casi en tiempo real tiene un impacto directo en la respuesta de salud pública a la pandemia de COVID-19. En este trabajo se presenta la importancia de la secuenciación genómica en microbiología, enfermedades infecciosas, epidemiología y salud pública, y se describe cómo se ha implementado la secuenciación de SARS-CoV-2 en Andalucía, y cuales son los principales resultados hasta la fecha.The incorporation of genomic sequencing techniques through next-generation sequencing has revolutionized clinical microbiology, innovating and improving the clinical diagnosis of infectious diseases. Today, whole genome sequencing in infectious diseases has many applications in virology, bacteriology, antibiotic resistance, epidemiology, and public health. With the appearance of SARS-CoV-2, the importance of the analysis and study of genetic sequences has been underlined. Since the initial identification of SARS-CoV-2, to date, more than 414,575 complete genomic sequences have been shared worldwide through public access databases. The ability to monitor viral evolution in near real time has a direct impact on the public health response to the COVID-19 pandemic. This paper presents the importance of genomic sequencing in microbiology, infectious diseases, epidemiology and public health, and describes how SARS-CoV-2 sequencing has been implemented in Andalusia, and what the main results are to date.Consejo Andaluz de Colegios de MédicosMicrobiología2022info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/11441/165907https://doi.org/10.15568/am.2021.814.rev03reponame:idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevillainstname:Universidad de Sevilla (US)EspañolActualidad médica, 106 (814), 291-300.https://doi.org/10.15568/am.2021.814.rev03info:eu-repo/semantics/openAccessoai:idus.us.es:11441/1659072026-06-17T12:51:07Z |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantes SARS-CoV-2 Genome Sequencing in Andalusia, Methodology and Study of Variants |
| title |
Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantes |
| spellingShingle |
Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantes Salazar, Adolfo de Secuenciación genómica SARS-CoV-2 Variantes Andalucía. |
| title_short |
Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantes |
| title_full |
Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantes |
| title_fullStr |
Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantes |
| title_full_unstemmed |
Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantes |
| title_sort |
Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantes |
| dc.creator.none.fl_str_mv |
Salazar, Adolfo de Fuentes López, Ana Viñuela, Laura Camacho Martínez, Pedro Chueca, Natalia Merino Díaz, Laura Pérez Florido, Javier Casimiro Soriguer, Carlos S. Dopazo Blázquez, Joaquín Lorusso, Nicola García, Federico Lepe Jiménez, José Antonio |
| author |
Salazar, Adolfo de |
| author_facet |
Salazar, Adolfo de Fuentes López, Ana Viñuela, Laura Camacho Martínez, Pedro Chueca, Natalia Merino Díaz, Laura Pérez Florido, Javier Casimiro Soriguer, Carlos S. Dopazo Blázquez, Joaquín Lorusso, Nicola García, Federico Lepe Jiménez, José Antonio |
| author_role |
author |
| author2 |
Fuentes López, Ana Viñuela, Laura Camacho Martínez, Pedro Chueca, Natalia Merino Díaz, Laura Pérez Florido, Javier Casimiro Soriguer, Carlos S. Dopazo Blázquez, Joaquín Lorusso, Nicola García, Federico Lepe Jiménez, José Antonio |
| author2_role |
author author author author author author author author author author author |
| dc.contributor.none.fl_str_mv |
Microbiología |
| dc.subject.none.fl_str_mv |
Secuenciación genómica SARS-CoV-2 Variantes Andalucía. |
| topic |
Secuenciación genómica SARS-CoV-2 Variantes Andalucía. |
| description |
La incorporación de las técnicas de secuenciación genómica mediante secuenciación de nueva generación ha revolucionado la microbiología clínica, innovando y mejorando el diagnóstico clínico de las enfermedades infecciosas. Hoy en día, la secuenciación de genoma completo en enfermedades infecciosas tiene multitud de aplicaciones en virología, bacteriología, resistencia antibiótica, epidemiología y salud pública. Con la aparición del SARS-CoV-2, se ha visto subrayada la importancia del análisis y estudio de las secuencias genéticas. Desde la identificación inicial del SARS-CoV-2, hasta la fecha, se han compartido, a nivel mundial, más de 414.575 secuencias genómicas completas a través de bases de datos de acceso público. La capacidad de monitorizar la evolución viral casi en tiempo real tiene un impacto directo en la respuesta de salud pública a la pandemia de COVID-19. En este trabajo se presenta la importancia de la secuenciación genómica en microbiología, enfermedades infecciosas, epidemiología y salud pública, y se describe cómo se ha implementado la secuenciación de SARS-CoV-2 en Andalucía, y cuales son los principales resultados hasta la fecha. |
| publishDate |
2022 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2022 |
| dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| format |
article |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.none.fl_str_mv |
https://hdl.handle.net/11441/165907 https://doi.org/10.15568/am.2021.814.rev03 |
| url |
https://hdl.handle.net/11441/165907 https://doi.org/10.15568/am.2021.814.rev03 |
| dc.language.none.fl_str_mv |
Español |
| language_invalid_str_mv |
Español |
| dc.relation.none.fl_str_mv |
Actualidad médica, 106 (814), 291-300. https://doi.org/10.15568/am.2021.814.rev03 |
| dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Consejo Andaluz de Colegios de Médicos |
| publisher.none.fl_str_mv |
Consejo Andaluz de Colegios de Médicos |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla instname:Universidad de Sevilla (US) |
| instname_str |
Universidad de Sevilla (US) |
| reponame_str |
idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla |
| collection |
idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla |
| repository.name.fl_str_mv |
|
| repository.mail.fl_str_mv |
|
| _version_ |
1869404452413243392 |
| score |
15.811543 |