Secuenciación del genoma del Sars-CoV-2 en Andalucía, metodología y estudio de las variantes

La incorporación de las técnicas de secuenciación genómica mediante secuenciación de nueva generación ha revolucionado la microbiología clínica, innovando y mejorando el diagnóstico clínico de las enfermedades infecciosas. Hoy en día, la secuenciación de genoma completo en enfermedades infecciosas t...

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Bibliographic Details
Authors: Salazar, Adolfo de, Fuentes López, Ana, Viñuela, Laura, Camacho Martínez, Pedro, Chueca, Natalia, Merino Díaz, Laura, Pérez Florido, Javier, Casimiro Soriguer, Carlos S., Dopazo Blázquez, Joaquín, Lorusso, Nicola, García, Federico, Lepe Jiménez, José Antonio
Format: article
Status:Published version
Publication Date:2022
Country:España
Institution:Universidad de Sevilla (US)
Repository:idUS. Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla
OAI Identifier:oai:idus.us.es:11441/165907
Online Access:https://hdl.handle.net/11441/165907
https://doi.org/10.15568/am.2021.814.rev03
Access Level:Open access
Keyword:Secuenciación genómica
SARS-CoV-2
Variantes
Andalucía.
Description
Summary:La incorporación de las técnicas de secuenciación genómica mediante secuenciación de nueva generación ha revolucionado la microbiología clínica, innovando y mejorando el diagnóstico clínico de las enfermedades infecciosas. Hoy en día, la secuenciación de genoma completo en enfermedades infecciosas tiene multitud de aplicaciones en virología, bacteriología, resistencia antibiótica, epidemiología y salud pública. Con la aparición del SARS-CoV-2, se ha visto subrayada la importancia del análisis y estudio de las secuencias genéticas. Desde la identificación inicial del SARS-CoV-2, hasta la fecha, se han compartido, a nivel mundial, más de 414.575 secuencias genómicas completas a través de bases de datos de acceso público. La capacidad de monitorizar la evolución viral casi en tiempo real tiene un impacto directo en la respuesta de salud pública a la pandemia de COVID-19. En este trabajo se presenta la importancia de la secuenciación genómica en microbiología, enfermedades infecciosas, epidemiología y salud pública, y se describe cómo se ha implementado la secuenciación de SARS-CoV-2 en Andalucía, y cuales son los principales resultados hasta la fecha.